Открытие сделали участники совместной археологической экспедиции Института археологии РАН, Новгородского государственного музея-заповедника и Новгородского университета имени Ярослава Мудрого.
При Борисе Годунове вокруг монастыря были поставлены каменные стены, которые простояли до конца XVIII века.
В ходе раскопок они обнаружили фрагменты двух православных храмов — Знаменской и Никольской церквей. Оба храма были построены в XVIII—XIX веках и полностью уничтожены при советской власти.
Внутри склепа археологи обнаружили останки около десяти человек.